种植专用EM菌灌根使用非常的简单，直接拿产品按1:500的比例兑水来浇灌大棚蔬菜的根部，使其改善根部周围的土质环境，杀菌灭菌，定期浇灌可以有效的预防接触根腐病的发生和传染。 种植专用EM菌喷洒使用是按1：100的比例兑水，用喷雾器直接喷洒大棚蔬菜的花朵，茎秆，页面，可以有效果的促进其生长，调高产量。 种植专用EM菌发酵生物有机肥材料按性质可分为三类： ① 易分解的物质，如秸秆、杂草、垃圾、粪便等，这类物质含纤维素、木质素、果胶较多，碳氮比较大，一般在60~100:1之间。 ②促进分解的物质，如人畜粪尿、污水、污泥和适量的化肥。其目的是补充足够的氮、磷、钾营养，调节碳氮比，增加各种促进腐熟的微生物。 　 ③吸收性强的物质，主要是加入一些粉碎的粘土、草炭、秸秆或锯末，用于吸附腐解过程中分解出来的易流失的氮、钾等营养元素，促进养分转化，形成高质量的有机肥。 　 堆、沤肥材料虽含有一定量的养分，但大都不能直接被作物吸收利用，通过种植专用EM菌堆沤腐熟过程，使有机物料尽快释放养分，还可经过发酵过程产生的高温杀灭寄生虫卵和各种病原菌